Η Γενική Διεύθυνση Αναπτυξιακού Προγραμματισμού, Περιφερειακής Πολιτικής και Δημοσίων Επενδύσεων του Υπουργείου Οικονομίας, Ανταγωνιστικότητας και Ναυτιλίας που ορίζεται σύμφωνα με το Νόμο 3614/2007 ως Εθνική Αρχή Συντονισμού του ΕΣΠΑ , είναι η αρχή που συντονίζει τον προγραμματισμό και την εφαρμογή των επιχειρησιακών προγραμμάτων του ΕΣΠΑ και καθοδηγεί τις διαχειριστικές αρχές με στόχο την εξασφάλιση της αποτελεσματικότητας και της νομιμότητας της διαχείρισης και της εφαρμογής των επιχειρησιακών προγραμμάτων. Οι βασικές της αρμοδιότητες είναι οι ακόλουθες :

• Είναι ο κύριος συνομιλητής της χώρας με την Επιτροπή για θέματα του ΕΣΠΑ.
• Παρακολουθεί και συντονίζει τον προγραμματισμό και την εφαρμογή του ΕΣΠΑ και των επιχειρησιακών προγραμμάτων του.
• Έχει την ευθύνη για το σχεδιασμό του συστήματος διαχείρισης και ελέγχου (ΣΔΕ) και εποπτεύει την αποτελεσματική εφαρμογή του και την προσαρμογή του ώστε να διασφαλίζεται η επίτευξη των στόχων του.
• Συντονίζει τις διαχειριστικές αρχές των επιχειρησιακών προγραμμάτων του ΕΣΠΑ και μεριμνά για την εφαρμογή των αποφάσεων της Διυπουργικής Επιτροπής Κοινοτικών Προγραμμάτων και της ετήσιας διάσκεψης προέδρων των επιτροπών παρακολούθησης των επιχειρησιακών προγραμμάτων του ΕΣΠΑ, του Προγράμματος Αγροτικής Ανάπτυξης (ΠΑΑ) και του Επιχειρησιακού Προγράμματος Αλιείας.
• Παρέχει οδηγίες για τη διενέργεια των αξιολογήσεων των επιχειρησιακών προγραμμάτων. και επεξεργάζεται τα πορίσματα τους ώστε να παρέχεο κατευθύνσεις στις διαχειριστικές αρχές σχετικά με την αναθεώρηση των επιχειρησιακών προγραμμάτων.
• Ενημερώνει τις διαχειριστικές αρχές σχετικά με το Κοινοτικό και Εθνικό Δίκαιο και ενημερώνεται για τις σχετικές ενέργειες των διαχειριστικών αρχών για τη διασφάλιση της συμβατότητας των παρεμβάσεων με το Εθνικό και Κοινοτικό Δίκαιο.
• Διαμορφώνει προτάσεις για τον προγραμματισμό και τη διαχείριση του εθνικού αποθεματικού απροβλέπτων.
• Διαμορφώνει και παρακολουθεί το πλαίσιο αρχών δημοσιότητας και πληροφόρησης για το ΕΣΠΑ και τα επιχειρησιακά προγράμματα, που συγχρηματοδοτούνται από τα Διαρθρωτικά Ταμεία και το Ταμείο Συνοχής, προκειμένου να εξασφαλίζεται η ομοιογένεια, η συνοχή και ο συντονισμός των μέτρων δημοσιότητας και πληροφόρησης των επιχειρησιακών προγραμμάτων.
• Παρακολουθεί την τήρηση των δεσμεύσεων για την προσθετικότητα και παρέχει στην Επιτροπή τις απαιτούμενες πληροφορίες για την επαλήθευσή της.
• Συγκεντρώνει και υποβάλλει τα αναγκαία στοιχεία σχετικά με τη συμβολή των επιχειρησιακών προγραμμάτων που συγχρηματοδοτούνται από τα Ταμεία στην εφαρμογή του Εθνικού Προγράμματος Μεταρρυθμίσεων.
• Συντάσσει τις εκθέσεις στρατηγικής παρακολούθησης του ΕΣΠΑ.
• Διασφαλίζει από κοινού με τις ειδικές υπηρεσίες διαχείρισης του ΠΑΑ και του επιχειρησιακού προγράμματος Αλιείας μεταξύ της συνδρομής των διαφόρων Ταμείων,) και το συντονισμό μεταξύ των Ταμείων και των παρεμβάσεων της Ευρωπαϊκής Τράπεζας Επενδύσεων (ΕΤΕπ) και άλλων χρηματοδοτικών μέσων.
• Μεριμνά για το συντονισμό του προγραμματισμού και της εφαρμογής των συγχρηματοδοτούμενων δράσεων κρατικών.
• Εισηγείται και εποπτεύει το σύστημα επιβεβαίωσης της διαχειριστικής επάρκειας δικαιούχων.
• Μεριμνά για την τήρηση των κατανομών των δαπανών των επιχειρησιακών προγραμμάτων του ΕΣΠΑ.
• Διαμορφώνει σε συνεργασία με την αρχή πιστοποίησης τους κανόνες για την επιλεξιμότητα των δαπανών και εκδίδει οδηγίες για την υποστήριξη των διαχειριστικών αρχών και των δικαιούχων.
• Παρέχει την απαραίτητη πληροφόρηση και διαμορφώνει εισηγήσεις προς τη Διυπουργική Επιτροπή των Κοινοτικών Προγραμμάτων και τη διάσκεψη των προέδρων των επιτροπών παρακολούθησης των επιχειρησιακών προγραμμάτων του ΕΣΠΑ, του προγράμματος Αγροτικής Ανάπτυξης και του επιχειρησιακού προγράμματος Αλιείας ενώ υποστηρίζει και τις εργασίες της τελευταίας.

• Διεύθυνση Δημοσίων Επενδύσεων
  
• Ειδική Υπηρεσία Στρατηγικής Σχεδιασμού και Αξιολόγησης Αναπτυξιακών Προγραμμάτων
  
• Ειδική Υπηρεσία Συντονισμού της Εφαρμογής των Επιχειρησιακών Προγραμμάτων
  
• Ειδική Υπηρεσία Θεσμικής Υποστήριξης
  
• Ειδική Υπηρεσία Διαχείρισης και Παρακολούθησης του Ταμείου Συνοχής
  
• Ειδική Υπηρεσία Διαχείρισης των Επιχειρησιακών Προγραμμάτων του Στόχου "ΕΥΡΩΠΑΪΚΗ ΕΔΑΦΙΚΗ ΣΥΝΕΡΓΑΣΙΑ"
  
• Υπηρεσία Ολοκληρωμένου Πληροφοριακού Συστήματος (Ο.Π.Σ.)